南宋以后，许多书院根据讲学需要，从事刻书。其经费来源主要靠政府拨给学田，支付官帑，所以书院刻书通常列入官刻范围。建阳古书院处在刻书业繁盛的环境里，刻书具有优越的条件。南宋以后，有的书院刻书力量雄厚，产生了刻书专业化的倾向，不少刻本流传于世，被称为“书院本”。特别是康熙晚期福州鳌峰书院刊刻的大型丛书《正谊堂全书》，闻名于世。

建宁府境内书院刻书有两个特点:一是范围广泛，经、史、子、集都有；二是多刻宋、明理学家著作。现择要介绍于下。

建宁建安书院:宋嘉熙二年（1238）建宁知府王埜在府治重建书院，匾称建安书院。先后刻书多种。知见有南宋初刊宋项安世《周易玩辞》16卷，宋嘉熙三年（1239）刊《晦庵先生文集》100卷，宋淳祐五年（1245）又刊《续集》10卷，并合并印行。宋咸淳元年（1265）由山长黄镛主持，合刻《晦庵先生朱文公文集》100卷、续集11卷、别集10卷。入元后，续有刻书，如元至正九年（1349）刊赵君信《蜀汉本末》3卷等。

建阳考亭书院:考亭原为朱熹之父朱松卜居之所。宋绍熙元年（1190）朱熹自崇安徙居于此，更匾曰沧洲，晚年在此讲学著述，对闽学发展影响极大。宋淳祐四年（1244）御赐“考亭书院”匾。元代以后多次重建修葺。由宋至清，多有刻书。知见有元大德间（1297-1307）刊《晦庵先生语录类要》18卷。明万历十七年（1589）刊《考亭志》。清雍正七年（1729）刊宋朱松《韦斋集》，清雍正八年（1730）刊又道光二十年重刊《朱子文集大全类编》110卷，等等。

建宁屏山书院:宋代学者刘子翚（号屏山）弃官归隐后于崇安创建书院，收徒讲学。宋淳祐二年（1242）理宗赐名“屏山”，元初毁于兵火。后在建宁府另建同名书院。知见有元至正十二年（1360）刊宋陈傅良《止斋先生文集》26卷、附录1卷、遗文1卷等。

建阳梅溪书院:刻书较多。知见有元大德十一年（1307）刊唐孙思邈《校正千金翼方》30卷，元泰定元年（1324）刊宋朱熹撰、滕洪辑《类编标注文公朱先生经济文衔》前集25卷、合集25卷、续集22卷，元元统二年（1334）刊宋阴时夫辑《韵府群玉》20卷等。

建阳鳌峰书院:在建阳县崇泰里熊墩，唐尚书熊秘建。知见有元至正十三年（1353）刊宋熊禾《勿轩易学启蒙图传通义》7卷等，又明代刊有宋赵令時《侯鲭录》8卷等。

建阳化龙书院:邑人刘应李建。知见有元刊宋刘《云庄刘文简公文集》13卷等。

建阳云庄书院:宋代学者刘故居。宋嘉定三年（1210）改建为书院。宋嘉熙三年（1239）御赐“云庄书院”匾。南宋以后多有刻书。知见有元刊宋祝穆辑《新编古今事文类聚》前集、后集、续集、别集、新集、外集共221卷。明代有正统九年（1444）刊刘《云庄刘文简公文集》12卷，嘉靖二十三年（1544）刊《古今说海》112卷等。清代有同治十三年（1874）重刊上引刘文集等。

建安椿庄书院:知见有元刊本陈元靓《纂图增新群书类要事林广记》42卷等。

崇安南山书院:南宋时朱熹门人蔡沈创建。知见有元至正二十六年（1366）刊宋陈彭年《广韵》5卷、《大广益会玉篇》30卷等。后者有日本庆长九年（1604）翻刻本。

詹氏建阳书院:知见有元大德年间（1297-1307）刊《新增决科古今源流至论》前集、续集、别集共30卷，元至正八年（1348）刊《千家注分类杜工部集》25卷等。

建阳同文书院:宋乾道年间（1165-1173）朱熹创建，后遭兵燹，元大德十一年重建。知见有明刊袁达《佩兰文集》3卷等。