嘉熙元年（公元1237年），宋慈被任命为邵武军（今邵武市）通判。宋慈到任不久，知军王埜离任，由宋慈代理。作为当地的父母官，宋慈为百姓做了一件大善事。

在宋代，农村有个奇怪的风俗，叫"不举子"，即生了孩子不养育，把婴溺死或扔掉。最初，这个风俗还有些迷信色彩．说五月初五生的儿子不祥，不吉利，所以"不举子"．这个"子"指的是男孩子。可是后来这个"子"竟演变成了包括男孩、女孩都在内的所有刚刚出生的婴儿，而且也不单指五月初五了。

在当时，福建"不举子"的风气盛行。由于地少人多，经济贫穷，许多家庭都把多生子女看作是沉重的负担。一些州郡以三男二女为限，超过此数即不养育，生下即在准备好的水盆中溺死。因良心上怕受到谴责，就起一个好听的名称，叫"洗儿"。邵武地区的"不举子"风气更是严重，不仅穷人家只要一个独子，就连富人家也不过二男一女。

虽然宋代朝廷明令禁止溺婴、弃婴、杀子，甚至对堕胎的人也予以三年徒刑的处罚，但是仍屡禁不止。对于"不举子"风俗的危害性，宋慈有深刻的认识。他认为：这会产生一系列的社会问题，严重危害施政与教化。如违背人伦道德，恶化社会风气；造成人口比例失衡，影响正常婚配和伦理秩序；引发拐卖人口等社会治安问题。

针对邵武境内存在的严重溺婴现象，宋慈仿效朱熹的父亲朱松，撰写和发布了《戒杀子文》的文告，并联合当地年老而有地位的士绅，一同劝解和呼吁当地民众珍爱小生命。在短短几个月的时间里，当地溺婴现象就得到有效遏制。

同时，宋慈针对穷人家因无力养育子女，多有弃婴的现象，仿效恩师真德秀此前在建康府（今江苏南京）创办"慈幼庄"的做法，也在邵武设立了"慈幼庄"。他的具体做法是：由官府拿出一些被没收充公的田地，召人租佃，立为一庄。利用所得的田租收入，收养弃婴。将弃婴寄养在乳母家中，按月支付费用，一直养到七岁。如果乳母有意将弃婴收养，或者找到了愿意收养弃婴的人家，听从其便，仍由"慈幼庄"支付养育费用。对于抱养一岁以下幼童的人家，补助二两银子。如被抱养的孩子患病，由"慈幼庄"承担医药费。如被抱养的孩子死亡，给抱养人家适当的补偿。在丰收之年，因被遗弃的婴儿稀少，"慈幼庄"收支有余，储蓄下来，作为荒年救济基金。

虽然宋慈只在邵武任职一年多，但后来的《邵武府志》却在《官志》中为他留下了精彩的一笔："通判邵武军，摄郡，有遗爱。"其中，"遗爱"是指留于后世而被人追怀的德行、恩惠、贡献等等。可见，该评价很高。