原籍德化县赤水吉岭，后迁居永春县桃城(城关)民国27年(1938年)10月，建瓯县第六区改为水吉特别行政区署(相当于县级政权机构)许清瑞即奉调任水吉特区第一任区长前两个月，闽北大刀会会首林乃导率300余会徒洗劫并火烧水吉街，数百户百姓无家可归，满目疮痍，百废待兴。许清瑞一上任就着手计划拓宽街面，将水吉街建成闽南街市风格的新街街道两旁的店面前各有近两米宽能荫蔽雨水阳光的走廊，方便行人、顾客往来。他出面向富豪募集资金，聘用6个医务人员，以三山(福州)会馆为院址，创办水吉卫生院。勒令禁吸鸦片，查封鸦片烟馆二处，惩办鸦片烟馆老板。

他任水吉特区区长时，正值国共两党合作抗日刚达成协议之际。能体察民情，识大体，顾大局，逢会便宣传抗战战绩，褒扬抗日英雄壮举，号召支援前方抗战。民国28年他提出“好男要当兵”的响亮口号，三次发动青年报名从军救国，有百余人参军，投入抗战。组织抗敌后援会、抗建(抗日建国)剧团，到城乡广泛宣传抗日道理，发动群众支援抗战，教唱《义勇军进行曲》等抗日歌曲，开展劝募活动。民国29年春，筹建水吉特区图书馆，配备6名专职人员，开展抗日宣传。

民国29年10月，水吉建县，许清瑞任县长。有一次，他下乡到回龙遇到庙会，他故意撞倒装神弄鬼的神棍。“县太爷不信邪”，时传为佳话。国30日本侵略军进逼浙赣线前方吃紧，军用物资大增，通货膨胀，严重影响国计民生。他为首组织水吉县物资评价委员会，自任主任委员，亲自按日审议物价行情，限制物价。同年，在水吉县还发起“一元献机运动”，如期完成捐钱买飞机支援抗战的任务。

在反共的闽浙赣三省绥靖指挥部成立后，他派行动队直接参与“清剿”政和与水吉边境的红军游击队，屠杀革命干部、群众，

他任职水吉期间重视体育工作，平整南浦溪边的沙滩为县运动场，发展体育运动，并于民国30年秋举办全县体育运动大会。民国31年春，创办水吉有史以来第一所初级中学。同年4月，清瑞调任建瓯政府主任秘书。抗战胜利后，赴台任职，病逝于台湾。